Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms