Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smchd1Q6P5D8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smchd1Q6P5D8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms