Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrimpolQ6P1E7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms