Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1Q6NXH3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpbp1Q6NXH3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms