Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RragbQ6NTA4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RragbQ6NTA4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms