Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SphkapQ6NSW3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms