Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amer3Q6NS69 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms