Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdcd11Q6NS46 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms