Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4galnt3Q6L8S8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4galnt3Q6L8S8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms