Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep78Q6IRU7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep78Q6IRU7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms