Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt40Q6IFX3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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