Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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