Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms