Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms