Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrcc1Q69ZB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms