Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Samd9lQ69Z37 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Samd9lQ69Z37 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms