Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms