Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1549Q68FD9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kiaa1549Q68FD9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms