Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms