Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms