Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PtprdQ64487 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PtprdQ64487 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PtprdQ64487 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PtprdQ64487 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PtprdQ64487 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PtprdQ64487 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprdQ64487 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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