Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PtprjQ64455 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PtprjQ64455 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PtprjQ64455 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprjQ64455 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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