Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Zeb1Q64318 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms