Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms