Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PatjQ63ZW7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms