Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vil1Q62468 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vil1Q62468 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms