Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms