Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms