Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufa4Q62425 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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