Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Supt6hQ62383 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt6hQ62383 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms