Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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