Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SypQ62277 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SypQ62277 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SypQ62277 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms