Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms