Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms