Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprrQ62132 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprrQ62132 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms