Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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