Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms