Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes3Q61657 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms