Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde3bQ61409 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms