Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms