Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lama5Q61001 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama5Q61001 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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