Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms