Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms