Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms