Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms