Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms