Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms