Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClpbQ60649 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ClpbQ60649 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms