Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2aQ60648 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2aQ60648 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms