Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CttnQ60598 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms